Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cmklr1P97468 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cmklr1P97468 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmklr1P97468 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmklr1P97468 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmklr1P97468 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmklr1P97468 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cmklr1P97468 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cmklr1P97468 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cmklr1P97468 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cmklr1P97468 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmklr1P97468 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmklr1P97468 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmklr1P97468 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmklr1P97468 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmklr1P97468 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cmklr1P97468 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cmklr1P97468 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cmklr1P97468 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cmklr1P97468 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cmklr1P97468 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cmklr1P97468 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cmklr1P97468 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cmklr1P97468 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cmklr1P97468 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cmklr1P97468 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cmklr1P97468 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cmklr1P97468 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cmklr1P97468 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cmklr1P97468 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cmklr1P97468 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cmklr1P97468 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cmklr1P97468 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cmklr1P97468 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cmklr1P97468 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cmklr1P97468 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cmklr1P97468 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmklr1P97468 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmklr1P97468 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmklr1P97468 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmklr1P97468 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmklr1P97468 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cmklr1P97468 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cmklr1P97468 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cmklr1P97468 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cmklr1P97468 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cmklr1P97468 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cmklr1P97468 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cmklr1P97468 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmklr1P97468 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmklr1P97468 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmklr1P97468 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmklr1P97468 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmklr1P97468 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmklr1P97468 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmklr1P97468 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmklr1P97468 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmklr1P97468 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmklr1P97468 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmklr1P97468 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmklr1P97468 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmklr1P97468 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmklr1P97468 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmklr1P97468 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmklr1P97468 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmklr1P97468 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmklr1P97468 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmklr1P97468 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmklr1P97468 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms