Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vgll3P85442 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vgll3P85442 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vgll3P85442 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vgll3P85442 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vgll3P85442 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vgll3P85442 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vgll3P85442 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vgll3P85442 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vgll3P85442 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vgll3P85442 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vgll3P85442 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Vgll3P85442 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Vgll3P85442 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vgll3P85442 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vgll3P85442 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vgll3P85442 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vgll3P85442 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vgll3P85442 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vgll3P85442 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vgll3P85442 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vgll3P85442 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vgll3P85442 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vgll3P85442 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vgll3P85442 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vgll3P85442 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vgll3P85442 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vgll3P85442 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vgll3P85442 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vgll3P85442 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vgll3P85442 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vgll3P85442 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vgll3P85442 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vgll3P85442 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vgll3P85442 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vgll3P85442 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vgll3P85442 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vgll3P85442 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vgll3P85442 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vgll3P85442 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vgll3P85442 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vgll3P85442 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vgll3P85442 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vgll3P85442 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vgll3P85442 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vgll3P85442 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vgll3P85442 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vgll3P85442 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vgll3P85442 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vgll3P85442 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vgll3P85442 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vgll3P85442 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vgll3P85442 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vgll3P85442 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vgll3P85442 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vgll3P85442 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vgll3P85442 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vgll3P85442 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vgll3P85442 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vgll3P85442 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vgll3P85442 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vgll3P85442 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vgll3P85442 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vgll3P85442 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vgll3P85442 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vgll3P85442 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Vgll3P85442 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vgll3P85442 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vgll3P85442 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vgll3P85442 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vgll3P85442 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vgll3P85442 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vgll3P85442 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vgll3P85442 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vgll3P85442 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vgll3P85442 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vgll3P85442 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Vgll3P85442 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vgll3P85442 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vgll3P85442 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vgll3P85442 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vgll3P85442 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vgll3P85442 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vgll3P85442 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vgll3P85442 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vgll3P85442 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vgll3P85442 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Vgll3P85442 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vgll3P85442 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vgll3P85442 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vgll3P85442 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vgll3P85442 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vgll3P85442 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vgll3P85442 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vgll3P85442 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vgll3P85442 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vgll3P85442 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vgll3P85442 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vgll3P85442 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vgll3P85442 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms