Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubg1P83887 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubg1P83887 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubg1P83887 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubg1P83887 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubg1P83887 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubg1P83887 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubg1P83887 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubg1P83887 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubg1P83887 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubg1P83887 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubg1P83887 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubg1P83887 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubg1P83887 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubg1P83887 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubg1P83887 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubg1P83887 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubg1P83887 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubg1P83887 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubg1P83887 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubg1P83887 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubg1P83887 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubg1P83887 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubg1P83887 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tubg1P83887 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubg1P83887 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubg1P83887 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tubg1P83887 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubg1P83887 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubg1P83887 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubg1P83887 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubg1P83887 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubg1P83887 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubg1P83887 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubg1P83887 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubg1P83887 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubg1P83887 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tubg1P83887 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubg1P83887 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubg1P83887 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubg1P83887 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubg1P83887 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubg1P83887 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubg1P83887 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubg1P83887 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubg1P83887 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubg1P83887 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubg1P83887 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubg1P83887 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubg1P83887 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubg1P83887 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubg1P83887 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubg1P83887 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubg1P83887 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubg1P83887 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubg1P83887 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubg1P83887 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubg1P83887 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubg1P83887 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubg1P83887 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubg1P83887 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubg1P83887 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubg1P83887 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubg1P83887 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubg1P83887 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubg1P83887 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubg1P83887 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms