Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp2P63044 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp2P63044 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp2P63044 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp2P63044 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp2P63044 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp2P63044 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp2P63044 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp2P63044 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp2P63044 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp2P63044 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp2P63044 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp2P63044 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp2P63044 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp2P63044 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp2P63044 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp2P63044 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp2P63044 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp2P63044 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp2P63044 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp2P63044 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp2P63044 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp2P63044 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp2P63044 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp2P63044 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp2P63044 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp2P63044 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp2P63044 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp2P63044 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp2P63044 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vamp2P63044 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vamp2P63044 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vamp2P63044 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vamp2P63044 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vamp2P63044 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vamp2P63044 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vamp2P63044 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vamp2P63044 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vamp2P63044 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vamp2P63044 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vamp2P63044 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vamp2P63044 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Vamp2P63044 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp2P63044 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp2P63044 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms