Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Csrnp1P59054 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Csrnp1P59054 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Csrnp1P59054 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Csrnp1P59054 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Csrnp1P59054 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Csrnp1P59054 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Csrnp1P59054 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Csrnp1P59054 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Csrnp1P59054 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Csrnp1P59054 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Csrnp1P59054 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Csrnp1P59054 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Csrnp1P59054 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Csrnp1P59054 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Csrnp1P59054 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Csrnp1P59054 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Csrnp1P59054 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Csrnp1P59054 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Csrnp1P59054 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Csrnp1P59054 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Csrnp1P59054 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Csrnp1P59054 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Csrnp1P59054 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Csrnp1P59054 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Csrnp1P59054 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Csrnp1P59054 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Csrnp1P59054 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Csrnp1P59054 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Csrnp1P59054 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Csrnp1P59054 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Csrnp1P59054 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Csrnp1P59054 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Csrnp1P59054 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Csrnp1P59054 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Csrnp1P59054 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Csrnp1P59054 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Csrnp1P59054 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Csrnp1P59054 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Csrnp1P59054 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Csrnp1P59054 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Csrnp1P59054 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Csrnp1P59054 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Csrnp1P59054 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Csrnp1P59054 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Csrnp1P59054 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Csrnp1P59054 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Csrnp1P59054 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Csrnp1P59054 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Csrnp1P59054 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Csrnp1P59054 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Csrnp1P59054 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Csrnp1P59054 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Csrnp1P59054 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Csrnp1P59054 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Csrnp1P59054 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Csrnp1P59054 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Csrnp1P59054 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Csrnp1P59054 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Csrnp1P59054 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Csrnp1P59054 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Csrnp1P59054 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Csrnp1P59054 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Csrnp1P59054 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Csrnp1P59054 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Csrnp1P59054 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Csrnp1P59054 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Csrnp1P59054 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Csrnp1P59054 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Csrnp1P59054 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Csrnp1P59054 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Csrnp1P59054 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Csrnp1P59054 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Csrnp1P59054 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Csrnp1P59054 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Csrnp1P59054 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Csrnp1P59054 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Csrnp1P59054 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Csrnp1P59054 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Csrnp1P59054 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Csrnp1P59054 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Csrnp1P59054 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Csrnp1P59054 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Csrnp1P59054 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Csrnp1P59054 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Csrnp1P59054 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Csrnp1P59054 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Csrnp1P59054 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Csrnp1P59054 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Csrnp1P59054 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Csrnp1P59054 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Csrnp1P59054 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Csrnp1P59054 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Csrnp1P59054 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Csrnp1P59054 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Csrnp1P59054 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Csrnp1P59054 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Csrnp1P59054 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Csrnp1P59054 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Csrnp1P59054 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 387.5 ms