Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubgcp3P58854 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubgcp3P58854 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubgcp3P58854 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tubgcp3P58854 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tubgcp3P58854 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Tubgcp3P58854 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tubgcp3P58854 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubgcp3P58854 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubgcp3P58854 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubgcp3P58854 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubgcp3P58854 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubgcp3P58854 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubgcp3P58854 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubgcp3P58854 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubgcp3P58854 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubgcp3P58854 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubgcp3P58854 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubgcp3P58854 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubgcp3P58854 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubgcp3P58854 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tubgcp3P58854 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubgcp3P58854 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubgcp3P58854 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubgcp3P58854 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubgcp3P58854 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubgcp3P58854 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubgcp3P58854 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubgcp3P58854 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubgcp3P58854 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubgcp3P58854 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubgcp3P58854 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubgcp3P58854 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubgcp3P58854 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp3P58854 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp3P58854 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubgcp3P58854 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubgcp3P58854 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubgcp3P58854 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubgcp3P58854 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubgcp3P58854 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubgcp3P58854 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubgcp3P58854 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubgcp3P58854 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubgcp3P58854 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubgcp3P58854 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubgcp3P58854 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubgcp3P58854 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubgcp3P58854 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubgcp3P58854 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubgcp3P58854 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubgcp3P58854 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubgcp3P58854 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubgcp3P58854 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubgcp3P58854 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tubgcp3P58854 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tubgcp3P58854 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tubgcp3P58854 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tubgcp3P58854 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubgcp3P58854 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubgcp3P58854 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubgcp3P58854 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubgcp3P58854 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubgcp3P58854 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubgcp3P58854 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubgcp3P58854 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubgcp3P58854 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubgcp3P58854 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubgcp3P58854 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubgcp3P58854 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubgcp3P58854 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubgcp3P58854 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubgcp3P58854 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubgcp3P58854 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubgcp3P58854 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubgcp3P58854 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubgcp3P58854 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubgcp3P58854 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubgcp3P58854 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubgcp3P58854 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubgcp3P58854 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubgcp3P58854 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubgcp3P58854 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubgcp3P58854 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubgcp3P58854 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubgcp3P58854 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubgcp3P58854 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubgcp3P58854 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubgcp3P58854 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubgcp3P58854 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubgcp3P58854 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubgcp3P58854 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubgcp3P58854 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubgcp3P58854 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubgcp3P58854 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubgcp3P58854 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubgcp3P58854 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubgcp3P58854 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubgcp3P58854 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubgcp3P58854 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms