Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tm6sf1P58749 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tm6sf1P58749 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tm6sf1P58749 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tm6sf1P58749 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tm6sf1P58749 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tm6sf1P58749 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tm6sf1P58749 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tm6sf1P58749 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Tm6sf1P58749 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tm6sf1P58749 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tm6sf1P58749 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Tm6sf1P58749 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tm6sf1P58749 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tm6sf1P58749 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tm6sf1P58749 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tm6sf1P58749 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tm6sf1P58749 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tm6sf1P58749 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tm6sf1P58749 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tm6sf1P58749 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tm6sf1P58749 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tm6sf1P58749 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tm6sf1P58749 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tm6sf1P58749 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tm6sf1P58749 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tm6sf1P58749 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tm6sf1P58749 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tm6sf1P58749 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tm6sf1P58749 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tm6sf1P58749 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tm6sf1P58749 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tm6sf1P58749 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tm6sf1P58749 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Tm6sf1P58749 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tm6sf1P58749 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Tm6sf1P58749 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tm6sf1P58749 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tm6sf1P58749 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tm6sf1P58749 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tm6sf1P58749 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Tm6sf1P58749 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Tm6sf1P58749 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tm6sf1P58749 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tm6sf1P58749 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tm6sf1P58749 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tm6sf1P58749 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tm6sf1P58749 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tm6sf1P58749 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tm6sf1P58749 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tm6sf1P58749 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tm6sf1P58749 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Tm6sf1P58749 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tm6sf1P58749 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Tm6sf1P58749 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tm6sf1P58749 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tm6sf1P58749 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tm6sf1P58749 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tm6sf1P58749 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tm6sf1P58749 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tm6sf1P58749 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tm6sf1P58749 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tm6sf1P58749 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tm6sf1P58749 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tm6sf1P58749 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tm6sf1P58749 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tm6sf1P58749 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tm6sf1P58749 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tm6sf1P58749 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tm6sf1P58749 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Tm6sf1P58749 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tm6sf1P58749 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tm6sf1P58749 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tm6sf1P58749 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tm6sf1P58749 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tm6sf1P58749 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tm6sf1P58749 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tm6sf1P58749 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tm6sf1P58749 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tm6sf1P58749 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tm6sf1P58749 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Tm6sf1P58749 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tm6sf1P58749 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tm6sf1P58749 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Tm6sf1P58749 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tm6sf1P58749 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tm6sf1P58749 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tm6sf1P58749 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tm6sf1P58749 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tm6sf1P58749 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tm6sf1P58749 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tm6sf1P58749 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tm6sf1P58749 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tm6sf1P58749 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tm6sf1P58749 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tm6sf1P58749 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tm6sf1P58749 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tm6sf1P58749 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tm6sf1P58749 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tm6sf1P58749 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms