Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab8aP55258 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab8aP55258 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab8aP55258 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab8aP55258 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab8aP55258 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab8aP55258 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab8aP55258 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab8aP55258 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab8aP55258 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab8aP55258 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab8aP55258 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab8aP55258 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab8aP55258 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab8aP55258 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab8aP55258 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab8aP55258 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab8aP55258 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab8aP55258 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab8aP55258 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab8aP55258 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab8aP55258 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rab8aP55258 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab8aP55258 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab8aP55258 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab8aP55258 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab8aP55258 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab8aP55258 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab8aP55258 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab8aP55258 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab8aP55258 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab8aP55258 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab8aP55258 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab8aP55258 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab8aP55258 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab8aP55258 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab8aP55258 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab8aP55258 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab8aP55258 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab8aP55258 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab8aP55258 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab8aP55258 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab8aP55258 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab8aP55258 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab8aP55258 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab8aP55258 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab8aP55258 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab8aP55258 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab8aP55258 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab8aP55258 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab8aP55258 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab8aP55258 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab8aP55258 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab8aP55258 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab8aP55258 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab8aP55258 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab8aP55258 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab8aP55258 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab8aP55258 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms