Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cacnb3P54285 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cacnb3P54285 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cacnb3P54285 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cacnb3P54285 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cacnb3P54285 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cacnb3P54285 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cacnb3P54285 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cacnb3P54285 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cacnb3P54285 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cacnb3P54285 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cacnb3P54285 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cacnb3P54285 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cacnb3P54285 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cacnb3P54285 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cacnb3P54285 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cacnb3P54285 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cacnb3P54285 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cacnb3P54285 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cacnb3P54285 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cacnb3P54285 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cacnb3P54285 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cacnb3P54285 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cacnb3P54285 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cacnb3P54285 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Cacnb3P54285 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Cacnb3P54285 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cacnb3P54285 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cacnb3P54285 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Cacnb3P54285 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cacnb3P54285 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cacnb3P54285 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cacnb3P54285 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cacnb3P54285 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cacnb3P54285 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cacnb3P54285 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cacnb3P54285 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacnb3P54285 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacnb3P54285 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacnb3P54285 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacnb3P54285 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacnb3P54285 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cacnb3P54285 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Cacnb3P54285 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Cacnb3P54285 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cacnb3P54285 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Cacnb3P54285 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cacnb3P54285 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cacnb3P54285 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cacnb3P54285 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cacnb3P54285 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Cacnb3P54285 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cacnb3P54285 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cacnb3P54285 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cacnb3P54285 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cacnb3P54285 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cacnb3P54285 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cacnb3P54285 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cacnb3P54285 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cacnb3P54285 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cacnb3P54285 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cacnb3P54285 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cacnb3P54285 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cacnb3P54285 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cacnb3P54285 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cacnb3P54285 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cacnb3P54285 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cacnb3P54285 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cacnb3P54285 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cacnb3P54285 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Cacnb3P54285 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cacnb3P54285 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cacnb3P54285 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cacnb3P54285 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cacnb3P54285 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cacnb3P54285 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cacnb3P54285 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cacnb3P54285 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cacnb3P54285 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cacnb3P54285 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cacnb3P54285 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Cacnb3P54285 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cacnb3P54285 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Cacnb3P54285 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cacnb3P54285 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cacnb3P54285 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cacnb3P54285 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cacnb3P54285 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cacnb3P54285 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cacnb3P54285 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cacnb3P54285 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cacnb3P54285 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cacnb3P54285 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cacnb3P54285 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cacnb3P54285 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cacnb3P54285 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cacnb3P54285 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cacnb3P54285 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cacnb3P54285 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Cacnb3P54285 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174 ms