Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SqleP52019 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SqleP52019 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SqleP52019 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SqleP52019 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SqleP52019 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SqleP52019 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SqleP52019 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SqleP52019 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SqleP52019 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SqleP52019 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SqleP52019 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SqleP52019 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SqleP52019 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SqleP52019 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SqleP52019 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SqleP52019 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SqleP52019 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SqleP52019 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SqleP52019 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SqleP52019 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SqleP52019 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SqleP52019 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SqleP52019 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SqleP52019 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SqleP52019 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SqleP52019 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SqleP52019 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SqleP52019 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SqleP52019 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SqleP52019 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SqleP52019 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SqleP52019 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SqleP52019 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SqleP52019 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SqleP52019 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SqleP52019 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SqleP52019 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SqleP52019 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SqleP52019 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SqleP52019 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SqleP52019 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SqleP52019 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SqleP52019 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SqleP52019 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SqleP52019 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SqleP52019 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SqleP52019 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SqleP52019 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SqleP52019 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SqleP52019 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SqleP52019 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SqleP52019 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SqleP52019 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SqleP52019 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SqleP52019 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SqleP52019 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SqleP52019 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SqleP52019 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SqleP52019 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SqleP52019 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SqleP52019 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SqleP52019 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SqleP52019 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SqleP52019 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SqleP52019 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SqleP52019 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SqleP52019 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SqleP52019 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SqleP52019 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SqleP52019 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SqleP52019 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SqleP52019 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SqleP52019 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SqleP52019 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SqleP52019 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SqleP52019 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SqleP52019 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SqleP52019 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SqleP52019 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SqleP52019 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SqleP52019 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SqleP52019 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SqleP52019 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SqleP52019 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SqleP52019 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SqleP52019 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SqleP52019 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SqleP52019 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SqleP52019 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SqleP52019 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SqleP52019 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SqleP52019 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SqleP52019 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SqleP52019 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SqleP52019 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SqleP52019 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SqleP52019 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SqleP52019 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SqleP52019 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms