Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
XpcP51612 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
XpcP51612 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
XpcP51612 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
XpcP51612 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
XpcP51612 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
XpcP51612 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
XpcP51612 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
XpcP51612 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
XpcP51612 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
XpcP51612 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
XpcP51612 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
XpcP51612 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
XpcP51612 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
XpcP51612 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
XpcP51612 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
XpcP51612 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
XpcP51612 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
XpcP51612 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
XpcP51612 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
XpcP51612 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
XpcP51612 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
XpcP51612 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
XpcP51612 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
XpcP51612 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
XpcP51612 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
XpcP51612 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
XpcP51612 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
XpcP51612 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
XpcP51612 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
XpcP51612 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
XpcP51612 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
XpcP51612 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
XpcP51612 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
XpcP51612 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
XpcP51612 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
XpcP51612 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
XpcP51612 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
XpcP51612 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
XpcP51612 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
XpcP51612 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
XpcP51612 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
XpcP51612 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
XpcP51612 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
XpcP51612 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
XpcP51612 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
XpcP51612 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
XpcP51612 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
XpcP51612 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
XpcP51612 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
XpcP51612 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
XpcP51612 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
XpcP51612 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
XpcP51612 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
XpcP51612 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
XpcP51612 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29■■■□□ 2.23
XpcP51612 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XpcP51612 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
XpcP51612 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
XpcP51612 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
XpcP51612 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
XpcP51612 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
XpcP51612 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
XpcP51612 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
XpcP51612 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
XpcP51612 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
XpcP51612 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
XpcP51612 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
XpcP51612 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
XpcP51612 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
XpcP51612 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
XpcP51612 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
XpcP51612 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
XpcP51612 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
XpcP51612 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
XpcP51612 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
XpcP51612 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
XpcP51612 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
XpcP51612 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
XpcP51612 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
XpcP51612 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
XpcP51612 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
XpcP51612 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
XpcP51612 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
XpcP51612 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
XpcP51612 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
XpcP51612 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
XpcP51612 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
XpcP51612 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
XpcP51612 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
XpcP51612 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
XpcP51612 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
XpcP51612 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
XpcP51612 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
XpcP51612 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
XpcP51612 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
XpcP51612 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
XpcP51612 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
XpcP51612 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
XpcP51612 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms