Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Defa-rs12P50716 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Defa-rs12P50716 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Defa-rs12P50716 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Defa-rs12P50716 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Defa-rs12P50716 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Defa-rs12P50716 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Defa-rs12P50716 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Defa-rs12P50716 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Defa-rs12P50716 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Defa-rs12P50716 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Defa-rs12P50716 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Defa-rs12P50716 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Defa-rs12P50716 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Defa-rs12P50716 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Defa-rs12P50716 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Defa-rs12P50716 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Defa-rs12P50716 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Defa-rs12P50716 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Defa-rs12P50716 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Defa-rs12P50716 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Defa-rs12P50716 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Defa-rs12P50716 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Defa-rs12P50716 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Defa-rs12P50716 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Defa-rs12P50716 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Defa-rs12P50716 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Defa-rs12P50716 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Defa-rs12P50716 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Defa-rs12P50716 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Defa-rs12P50716 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Defa-rs12P50716 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Defa-rs12P50716 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Defa-rs12P50716 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Defa-rs12P50716 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Defa-rs12P50716 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Defa-rs12P50716 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Defa-rs12P50716 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Defa-rs12P50716 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Defa-rs12P50716 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Defa-rs12P50716 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Defa-rs12P50716 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Defa-rs12P50716 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Defa-rs12P50716 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Defa-rs12P50716 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Defa-rs12P50716 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Defa-rs12P50716 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Defa-rs12P50716 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Defa-rs12P50716 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Defa-rs12P50716 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Defa-rs12P50716 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Defa-rs12P50716 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Defa-rs12P50716 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Defa-rs12P50716 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Defa-rs12P50716 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Defa-rs12P50716 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Defa-rs12P50716 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Defa-rs12P50716 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Defa-rs12P50716 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Defa-rs12P50716 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Defa-rs12P50716 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Defa-rs12P50716 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Defa-rs12P50716 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Defa-rs12P50716 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Defa-rs12P50716 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Defa-rs12P50716 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Defa-rs12P50716 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Defa-rs12P50716 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Defa-rs12P50716 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Defa-rs12P50716 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Defa-rs12P50716 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Defa-rs12P50716 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Defa-rs12P50716 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Defa-rs12P50716 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Defa-rs12P50716 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Defa-rs12P50716 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Defa-rs12P50716 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Defa-rs12P50716 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Defa-rs12P50716 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Defa-rs12P50716 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Defa-rs12P50716 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Defa-rs12P50716 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Defa-rs12P50716 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Defa-rs12P50716 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Defa-rs12P50716 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Defa-rs12P50716 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Defa-rs12P50716 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Defa-rs12P50716 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Defa-rs12P50716 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Defa-rs12P50716 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Defa-rs12P50716 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Defa-rs12P50716 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Defa-rs12P50716 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Defa-rs12P50716 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Defa-rs12P50716 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Defa-rs12P50716 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Defa-rs12P50716 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Defa-rs12P50716 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Defa-rs12P50716 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Defa-rs12P50716 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms