Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox2P48432 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox2P48432 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox2P48432 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox2P48432 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox2P48432 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox2P48432 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox2P48432 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox2P48432 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox2P48432 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox2P48432 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sox2P48432 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox2P48432 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox2P48432 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox2P48432 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox2P48432 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox2P48432 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox2P48432 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox2P48432 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox2P48432 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox2P48432 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox2P48432 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox2P48432 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox2P48432 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox2P48432 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox2P48432 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox2P48432 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox2P48432 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox2P48432 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox2P48432 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox2P48432 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox2P48432 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox2P48432 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox2P48432 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox2P48432 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox2P48432 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox2P48432 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox2P48432 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox2P48432 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox2P48432 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox2P48432 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox2P48432 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox2P48432 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox2P48432 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox2P48432 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox2P48432 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox2P48432 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox2P48432 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox2P48432 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox2P48432 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox2P48432 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox2P48432 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox2P48432 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox2P48432 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox2P48432 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox2P48432 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox2P48432 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox2P48432 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox2P48432 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox2P48432 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox2P48432 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox2P48432 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox2P48432 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox2P48432 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox2P48432 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox2P48432 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox2P48432 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox2P48432 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox2P48432 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox2P48432 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox2P48432 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox2P48432 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox2P48432 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox2P48432 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox2P48432 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox2P48432 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox2P48432 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox2P48432 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox2P48432 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox2P48432 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox2P48432 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox2P48432 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox2P48432 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox2P48432 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox2P48432 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sox2P48432 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox2P48432 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox2P48432 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox2P48432 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox2P48432 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox2P48432 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox2P48432 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox2P48432 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox2P48432 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox2P48432 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox2P48432 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox2P48432 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox2P48432 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox2P48432 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox2P48432 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms