Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CratP47934 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CratP47934 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CratP47934 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CratP47934 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CratP47934 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CratP47934 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CratP47934 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CratP47934 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CratP47934 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CratP47934 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CratP47934 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CratP47934 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CratP47934 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CratP47934 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CratP47934 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CratP47934 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CratP47934 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CratP47934 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CratP47934 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CratP47934 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CratP47934 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CratP47934 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CratP47934 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CratP47934 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CratP47934 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CratP47934 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CratP47934 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CratP47934 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CratP47934 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CratP47934 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CratP47934 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CratP47934 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CratP47934 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CratP47934 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CratP47934 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CratP47934 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CratP47934 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CratP47934 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CratP47934 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CratP47934 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CratP47934 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CratP47934 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CratP47934 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CratP47934 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CratP47934 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CratP47934 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CratP47934 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CratP47934 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CratP47934 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CratP47934 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CratP47934 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CratP47934 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CratP47934 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CratP47934 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CratP47934 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CratP47934 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CratP47934 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CratP47934 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CratP47934 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CratP47934 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CratP47934 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CratP47934 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CratP47934 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CratP47934 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CratP47934 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CratP47934 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CratP47934 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CratP47934 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CratP47934 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CratP47934 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CratP47934 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CratP47934 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CratP47934 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CratP47934 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CratP47934 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CratP47934 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CratP47934 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CratP47934 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CratP47934 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CratP47934 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CratP47934 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CratP47934 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CratP47934 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CratP47934 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CratP47934 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CratP47934 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CratP47934 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CratP47934 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CratP47934 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CratP47934 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CratP47934 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CratP47934 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CratP47934 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CratP47934 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CratP47934 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CratP47934 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CratP47934 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CratP47934 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CratP47934 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms