Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccr7P47774 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccr7P47774 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccr7P47774 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccr7P47774 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccr7P47774 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccr7P47774 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccr7P47774 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccr7P47774 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccr7P47774 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccr7P47774 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccr7P47774 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccr7P47774 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccr7P47774 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccr7P47774 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccr7P47774 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccr7P47774 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccr7P47774 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccr7P47774 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccr7P47774 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccr7P47774 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccr7P47774 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccr7P47774 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccr7P47774 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccr7P47774 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccr7P47774 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccr7P47774 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccr7P47774 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccr7P47774 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccr7P47774 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccr7P47774 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccr7P47774 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccr7P47774 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccr7P47774 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccr7P47774 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccr7P47774 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccr7P47774 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccr7P47774 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccr7P47774 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccr7P47774 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccr7P47774 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccr7P47774 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccr7P47774 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccr7P47774 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccr7P47774 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccr7P47774 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccr7P47774 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccr7P47774 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccr7P47774 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccr7P47774 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccr7P47774 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccr7P47774 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccr7P47774 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccr7P47774 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccr7P47774 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccr7P47774 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccr7P47774 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccr7P47774 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccr7P47774 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccr7P47774 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccr7P47774 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccr7P47774 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr7P47774 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccr7P47774 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccr7P47774 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccr7P47774 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccr7P47774 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccr7P47774 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccr7P47774 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccr7P47774 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccr7P47774 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccr7P47774 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccr7P47774 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccr7P47774 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccr7P47774 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccr7P47774 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccr7P47774 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccr7P47774 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccr7P47774 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccr7P47774 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccr7P47774 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccr7P47774 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccr7P47774 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccr7P47774 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccr7P47774 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccr7P47774 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccr7P47774 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccr7P47774 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccr7P47774 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccr7P47774 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccr7P47774 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccr7P47774 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccr7P47774 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccr7P47774 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccr7P47774 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccr7P47774 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccr7P47774 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccr7P47774 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccr7P47774 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccr7P47774 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms