Protein–RNA interactions for Protein: P46718

Pdcd2, Programmed cell death protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd2P46718 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd2P46718 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pdcd2P46718 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcd2P46718 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd2P46718 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd2P46718 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd2P46718 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd2P46718 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd2P46718 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd2P46718 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd2P46718 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd2P46718 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd2P46718 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd2P46718 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd2P46718 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd2P46718 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd2P46718 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd2P46718 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd2P46718 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd2P46718 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd2P46718 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd2P46718 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd2P46718 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcd2P46718 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcd2P46718 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd2P46718 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd2P46718 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd2P46718 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd2P46718 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd2P46718 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd2P46718 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd2P46718 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd2P46718 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd2P46718 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcd2P46718 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd2P46718 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd2P46718 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcd2P46718 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcd2P46718 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms