Protein–RNA interactions for Protein: P43688

Nkx2-6, Homeobox protein Nkx-2.6, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-6P43688 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx2-6P43688 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-6P43688 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-6P43688 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx2-6P43688 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx2-6P43688 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx2-6P43688 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-6P43688 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-6P43688 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-6P43688 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-6P43688 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-6P43688 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-6P43688 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-6P43688 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-6P43688 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx2-6P43688 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx2-6P43688 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx2-6P43688 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-6P43688 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-6P43688 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-6P43688 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-6P43688 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-6P43688 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-6P43688 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-6P43688 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-6P43688 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-6P43688 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-6P43688 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-6P43688 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-6P43688 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx2-6P43688 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx2-6P43688 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx2-6P43688 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx2-6P43688 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx2-6P43688 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx2-6P43688 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx2-6P43688 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx2-6P43688 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx2-6P43688 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx2-6P43688 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx2-6P43688 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx2-6P43688 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx2-6P43688 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx2-6P43688 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx2-6P43688 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx2-6P43688 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx2-6P43688 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx2-6P43688 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-6P43688 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-6P43688 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-6P43688 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-6P43688 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-6P43688 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx2-6P43688 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx2-6P43688 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx2-6P43688 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx2-6P43688 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx2-6P43688 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx2-6P43688 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx2-6P43688 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx2-6P43688 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-6P43688 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-6P43688 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-6P43688 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-6P43688 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-6P43688 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-6P43688 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-6P43688 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-6P43688 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-6P43688 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-6P43688 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-6P43688 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-6P43688 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms