Protein–RNA interactions for Protein: P43252

Ptgir, Prostacyclin receptor, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgirP43252 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtgirP43252 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtgirP43252 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtgirP43252 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtgirP43252 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtgirP43252 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtgirP43252 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtgirP43252 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtgirP43252 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtgirP43252 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtgirP43252 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtgirP43252 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtgirP43252 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtgirP43252 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtgirP43252 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtgirP43252 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtgirP43252 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtgirP43252 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtgirP43252 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtgirP43252 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtgirP43252 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtgirP43252 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtgirP43252 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtgirP43252 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtgirP43252 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtgirP43252 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtgirP43252 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtgirP43252 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtgirP43252 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtgirP43252 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtgirP43252 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtgirP43252 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtgirP43252 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PtgirP43252 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtgirP43252 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtgirP43252 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtgirP43252 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtgirP43252 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtgirP43252 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtgirP43252 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtgirP43252 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtgirP43252 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PtgirP43252 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtgirP43252 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtgirP43252 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtgirP43252 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtgirP43252 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtgirP43252 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtgirP43252 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms