Protein–RNA interactions for Protein: P41317

Mbl2, Mannose-binding protein C, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbl2P41317 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbl2P41317 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbl2P41317 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mbl2P41317 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mbl2P41317 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mbl2P41317 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mbl2P41317 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Mbl2P41317 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbl2P41317 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbl2P41317 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mbl2P41317 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbl2P41317 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbl2P41317 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mbl2P41317 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbl2P41317 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbl2P41317 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbl2P41317 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mbl2P41317 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbl2P41317 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbl2P41317 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbl2P41317 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mbl2P41317 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbl2P41317 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbl2P41317 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbl2P41317 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mbl2P41317 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbl2P41317 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mbl2P41317 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Mbl2P41317 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbl2P41317 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbl2P41317 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbl2P41317 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mbl2P41317 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbl2P41317 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbl2P41317 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbl2P41317 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbl2P41317 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbl2P41317 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbl2P41317 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbl2P41317 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbl2P41317 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbl2P41317 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbl2P41317 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbl2P41317 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbl2P41317 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbl2P41317 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbl2P41317 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbl2P41317 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbl2P41317 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mbl2P41317 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mbl2P41317 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mbl2P41317 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbl2P41317 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbl2P41317 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbl2P41317 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mbl2P41317 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mbl2P41317 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbl2P41317 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbl2P41317 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbl2P41317 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbl2P41317 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbl2P41317 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbl2P41317 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mbl2P41317 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mbl2P41317 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mbl2P41317 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mbl2P41317 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mbl2P41317 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mbl2P41317 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbl2P41317 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbl2P41317 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbl2P41317 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbl2P41317 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbl2P41317 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbl2P41317 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Mbl2P41317 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Mbl2P41317 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mbl2P41317 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mbl2P41317 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mbl2P41317 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Mbl2P41317 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Mbl2P41317 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbl2P41317 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbl2P41317 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mbl2P41317 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbl2P41317 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbl2P41317 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbl2P41317 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbl2P41317 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbl2P41317 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbl2P41317 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbl2P41317 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbl2P41317 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbl2P41317 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbl2P41317 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbl2P41317 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbl2P41317 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbl2P41317 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbl2P41317 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbl2P41317 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms