Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Chd1P40201 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Chd1P40201 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
Chd1P40201 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Chd1P40201 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Chd1P40201 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Chd1P40201 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Chd1P40201 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Chd1P40201 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Chd1P40201 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Chd1P40201 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Chd1P40201 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Chd1P40201 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
Chd1P40201 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Chd1P40201 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Chd1P40201 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Chd1P40201 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Chd1P40201 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Chd1P40201 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Chd1P40201 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Chd1P40201 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Chd1P40201 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Chd1P40201 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Chd1P40201 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Chd1P40201 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Chd1P40201 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Chd1P40201 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Chd1P40201 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Chd1P40201 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Chd1P40201 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Chd1P40201 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Chd1P40201 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Chd1P40201 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Chd1P40201 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Chd1P40201 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Chd1P40201 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Chd1P40201 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Chd1P40201 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Chd1P40201 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Chd1P40201 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Chd1P40201 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Chd1P40201 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Chd1P40201 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Chd1P40201 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Chd1P40201 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Chd1P40201 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Chd1P40201 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Chd1P40201 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Chd1P40201 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
Chd1P40201 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Chd1P40201 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Chd1P40201 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Chd1P40201 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Chd1P40201 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Chd1P40201 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Chd1P40201 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Chd1P40201 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Chd1P40201 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Chd1P40201 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Chd1P40201 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Chd1P40201 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
Chd1P40201 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Chd1P40201 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Chd1P40201 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Chd1P40201 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Chd1P40201 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Chd1P40201 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Chd1P40201 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Chd1P40201 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Chd1P40201 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Chd1P40201 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Chd1P40201 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Chd1P40201 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Chd1P40201 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Chd1P40201 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Chd1P40201 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Chd1P40201 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Chd1P40201 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Chd1P40201 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Chd1P40201 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Chd1P40201 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Chd1P40201 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Chd1P40201 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Chd1P40201 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Chd1P40201 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Chd1P40201 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Chd1P40201 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Chd1P40201 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Chd1P40201 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Chd1P40201 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Chd1P40201 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Chd1P40201 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Chd1P40201 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Chd1P40201 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Chd1P40201 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Chd1P40201 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Chd1P40201 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Chd1P40201 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Chd1P40201 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Chd1P40201 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms