Protein–RNA interactions for Protein: P39688

Fyn, Tyrosine-protein kinase Fyn, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FynP39688 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FynP39688 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FynP39688 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FynP39688 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FynP39688 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FynP39688 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FynP39688 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FynP39688 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FynP39688 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FynP39688 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FynP39688 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FynP39688 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FynP39688 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FynP39688 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FynP39688 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FynP39688 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FynP39688 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FynP39688 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FynP39688 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FynP39688 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FynP39688 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FynP39688 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FynP39688 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FynP39688 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FynP39688 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FynP39688 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FynP39688 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FynP39688 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FynP39688 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FynP39688 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FynP39688 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FynP39688 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FynP39688 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FynP39688 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FynP39688 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FynP39688 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FynP39688 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FynP39688 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FynP39688 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FynP39688 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FynP39688 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FynP39688 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FynP39688 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FynP39688 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FynP39688 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FynP39688 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FynP39688 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FynP39688 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FynP39688 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FynP39688 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FynP39688 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FynP39688 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FynP39688 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FynP39688 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FynP39688 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FynP39688 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FynP39688 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FynP39688 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FynP39688 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FynP39688 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FynP39688 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FynP39688 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FynP39688 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FynP39688 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FynP39688 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FynP39688 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FynP39688 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FynP39688 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FynP39688 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FynP39688 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FynP39688 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FynP39688 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FynP39688 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FynP39688 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FynP39688 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FynP39688 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FynP39688 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FynP39688 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FynP39688 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FynP39688 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FynP39688 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FynP39688 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FynP39688 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FynP39688 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FynP39688 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FynP39688 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FynP39688 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FynP39688 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FynP39688 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FynP39688 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FynP39688 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FynP39688 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FynP39688 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FynP39688 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FynP39688 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FynP39688 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FynP39688 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FynP39688 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FynP39688 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FynP39688 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms