Protein–RNA interactions for Protein: P39038

Cdh4, Cadherin-4, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh4P39038 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh4P39038 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh4P39038 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh4P39038 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh4P39038 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh4P39038 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh4P39038 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh4P39038 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh4P39038 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh4P39038 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh4P39038 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh4P39038 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh4P39038 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh4P39038 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh4P39038 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh4P39038 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh4P39038 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh4P39038 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh4P39038 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh4P39038 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh4P39038 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh4P39038 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh4P39038 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh4P39038 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh4P39038 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh4P39038 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh4P39038 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh4P39038 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh4P39038 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh4P39038 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh4P39038 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh4P39038 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh4P39038 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh4P39038 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh4P39038 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh4P39038 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh4P39038 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh4P39038 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh4P39038 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh4P39038 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh4P39038 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh4P39038 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh4P39038 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh4P39038 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh4P39038 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh4P39038 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh4P39038 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh4P39038 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh4P39038 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh4P39038 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh4P39038 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh4P39038 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh4P39038 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh4P39038 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh4P39038 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh4P39038 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh4P39038 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh4P39038 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh4P39038 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh4P39038 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh4P39038 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh4P39038 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh4P39038 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh4P39038 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh4P39038 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh4P39038 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh4P39038 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh4P39038 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh4P39038 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh4P39038 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh4P39038 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh4P39038 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh4P39038 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh4P39038 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.4 ms