Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ly6dP35459 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ly6dP35459 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ly6dP35459 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ly6dP35459 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ly6dP35459 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ly6dP35459 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ly6dP35459 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ly6dP35459 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ly6dP35459 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ly6dP35459 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ly6dP35459 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ly6dP35459 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ly6dP35459 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ly6dP35459 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ly6dP35459 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ly6dP35459 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ly6dP35459 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ly6dP35459 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ly6dP35459 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ly6dP35459 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ly6dP35459 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ly6dP35459 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ly6dP35459 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ly6dP35459 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ly6dP35459 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ly6dP35459 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ly6dP35459 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ly6dP35459 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ly6dP35459 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ly6dP35459 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ly6dP35459 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ly6dP35459 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ly6dP35459 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ly6dP35459 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ly6dP35459 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ly6dP35459 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ly6dP35459 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ly6dP35459 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ly6dP35459 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ly6dP35459 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ly6dP35459 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ly6dP35459 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ly6dP35459 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ly6dP35459 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ly6dP35459 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ly6dP35459 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ly6dP35459 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ly6dP35459 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ly6dP35459 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ly6dP35459 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ly6dP35459 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ly6dP35459 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ly6dP35459 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ly6dP35459 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ly6dP35459 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ly6dP35459 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ly6dP35459 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ly6dP35459 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ly6dP35459 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ly6dP35459 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ly6dP35459 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ly6dP35459 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ly6dP35459 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ly6dP35459 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ly6dP35459 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ly6dP35459 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ly6dP35459 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ly6dP35459 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ly6dP35459 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ly6dP35459 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ly6dP35459 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ly6dP35459 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ly6dP35459 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ly6dP35459 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ly6dP35459 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ly6dP35459 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ly6dP35459 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ly6dP35459 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ly6dP35459 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ly6dP35459 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ly6dP35459 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ly6dP35459 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ly6dP35459 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ly6dP35459 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ly6dP35459 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ly6dP35459 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ly6dP35459 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ly6dP35459 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ly6dP35459 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ly6dP35459 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ly6dP35459 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ly6dP35459 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ly6dP35459 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ly6dP35459 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ly6dP35459 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ly6dP35459 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ly6dP35459 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ly6dP35459 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ly6dP35459 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms