Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp12P34960 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp12P34960 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mmp12P34960 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp12P34960 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp12P34960 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp12P34960 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp12P34960 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp12P34960 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp12P34960 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mmp12P34960 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp12P34960 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mmp12P34960 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp12P34960 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp12P34960 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mmp12P34960 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp12P34960 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp12P34960 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp12P34960 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp12P34960 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp12P34960 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp12P34960 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp12P34960 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp12P34960 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Mmp12P34960 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp12P34960 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp12P34960 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp12P34960 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp12P34960 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp12P34960 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp12P34960 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp12P34960 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp12P34960 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp12P34960 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp12P34960 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp12P34960 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp12P34960 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp12P34960 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp12P34960 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp12P34960 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp12P34960 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp12P34960 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp12P34960 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp12P34960 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp12P34960 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp12P34960 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp12P34960 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp12P34960 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp12P34960 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp12P34960 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp12P34960 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp12P34960 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp12P34960 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp12P34960 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp12P34960 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp12P34960 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp12P34960 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mmp12P34960 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp12P34960 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp12P34960 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp12P34960 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp12P34960 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp12P34960 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp12P34960 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp12P34960 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp12P34960 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp12P34960 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp12P34960 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp12P34960 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp12P34960 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp12P34960 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp12P34960 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp12P34960 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp12P34960 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp12P34960 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp12P34960 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp12P34960 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp12P34960 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp12P34960 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp12P34960 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mmp12P34960 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mmp12P34960 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp12P34960 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp12P34960 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp12P34960 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp12P34960 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp12P34960 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp12P34960 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp12P34960 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp12P34960 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp12P34960 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp12P34960 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp12P34960 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp12P34960 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp12P34960 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mmp12P34960 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp12P34960 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp12P34960 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp12P34960 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp12P34960 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms