Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VtnP29788 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VtnP29788 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VtnP29788 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VtnP29788 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VtnP29788 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VtnP29788 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VtnP29788 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VtnP29788 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VtnP29788 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VtnP29788 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VtnP29788 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VtnP29788 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VtnP29788 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VtnP29788 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VtnP29788 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VtnP29788 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VtnP29788 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VtnP29788 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VtnP29788 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VtnP29788 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VtnP29788 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VtnP29788 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VtnP29788 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VtnP29788 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VtnP29788 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
VtnP29788 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VtnP29788 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
VtnP29788 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VtnP29788 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VtnP29788 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VtnP29788 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VtnP29788 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VtnP29788 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VtnP29788 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VtnP29788 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VtnP29788 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VtnP29788 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VtnP29788 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VtnP29788 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VtnP29788 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VtnP29788 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VtnP29788 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VtnP29788 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VtnP29788 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VtnP29788 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VtnP29788 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VtnP29788 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VtnP29788 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VtnP29788 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VtnP29788 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VtnP29788 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VtnP29788 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VtnP29788 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VtnP29788 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VtnP29788 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VtnP29788 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VtnP29788 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VtnP29788 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VtnP29788 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VtnP29788 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VtnP29788 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VtnP29788 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VtnP29788 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VtnP29788 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VtnP29788 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VtnP29788 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VtnP29788 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VtnP29788 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VtnP29788 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VtnP29788 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VtnP29788 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VtnP29788 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VtnP29788 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VtnP29788 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VtnP29788 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VtnP29788 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VtnP29788 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VtnP29788 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VtnP29788 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VtnP29788 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VtnP29788 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VtnP29788 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VtnP29788 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VtnP29788 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VtnP29788 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VtnP29788 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VtnP29788 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VtnP29788 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VtnP29788 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VtnP29788 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VtnP29788 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VtnP29788 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VtnP29788 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VtnP29788 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VtnP29788 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VtnP29788 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VtnP29788 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VtnP29788 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VtnP29788 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms