Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkcdP28867 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcdP28867 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PrkcdP28867 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkcdP28867 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkcdP28867 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkcdP28867 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkcdP28867 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcdP28867 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcdP28867 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcdP28867 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcdP28867 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkcdP28867 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkcdP28867 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkcdP28867 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkcdP28867 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkcdP28867 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkcdP28867 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkcdP28867 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkcdP28867 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkcdP28867 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkcdP28867 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkcdP28867 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkcdP28867 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkcdP28867 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkcdP28867 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkcdP28867 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkcdP28867 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkcdP28867 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcdP28867 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcdP28867 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcdP28867 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcdP28867 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcdP28867 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrkcdP28867 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrkcdP28867 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkcdP28867 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkcdP28867 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkcdP28867 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkcdP28867 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkcdP28867 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkcdP28867 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkcdP28867 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkcdP28867 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkcdP28867 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkcdP28867 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkcdP28867 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkcdP28867 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkcdP28867 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkcdP28867 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms