Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
PtprmP28828 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PtprmP28828 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PtprmP28828 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PtprmP28828 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PtprmP28828 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PtprmP28828 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PtprmP28828 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PtprmP28828 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PtprmP28828 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PtprmP28828 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PtprmP28828 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PtprmP28828 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PtprmP28828 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
PtprmP28828 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PtprmP28828 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PtprmP28828 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PtprmP28828 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PtprmP28828 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PtprmP28828 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PtprmP28828 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PtprmP28828 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
PtprmP28828 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PtprmP28828 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PtprmP28828 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PtprmP28828 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PtprmP28828 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
PtprmP28828 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
PtprmP28828 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
PtprmP28828 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PtprmP28828 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PtprmP28828 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PtprmP28828 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PtprmP28828 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PtprmP28828 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PtprmP28828 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PtprmP28828 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PtprmP28828 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PtprmP28828 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PtprmP28828 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PtprmP28828 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PtprmP28828 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PtprmP28828 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PtprmP28828 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PtprmP28828 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
PtprmP28828 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PtprmP28828 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
PtprmP28828 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PtprmP28828 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PtprmP28828 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PtprmP28828 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PtprmP28828 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
PtprmP28828 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
PtprmP28828 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PtprmP28828 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PtprmP28828 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PtprmP28828 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PtprmP28828 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PtprmP28828 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PtprmP28828 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PtprmP28828 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PtprmP28828 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PtprmP28828 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
PtprmP28828 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PtprmP28828 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PtprmP28828 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PtprmP28828 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
PtprmP28828 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PtprmP28828 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PtprmP28828 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PtprmP28828 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PtprmP28828 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PtprmP28828 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PtprmP28828 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PtprmP28828 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PtprmP28828 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PtprmP28828 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PtprmP28828 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PtprmP28828 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PtprmP28828 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PtprmP28828 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PtprmP28828 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PtprmP28828 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PtprmP28828 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PtprmP28828 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PtprmP28828 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PtprmP28828 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PtprmP28828 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PtprmP28828 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PtprmP28828 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PtprmP28828 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PtprmP28828 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PtprmP28828 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PtprmP28828 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PtprmP28828 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PtprmP28828 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PtprmP28828 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PtprmP28828 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PtprmP28828 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PtprmP28828 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
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