Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atxn10P28658 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atxn10P28658 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atxn10P28658 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atxn10P28658 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atxn10P28658 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atxn10P28658 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atxn10P28658 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atxn10P28658 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atxn10P28658 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atxn10P28658 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn10P28658 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn10P28658 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn10P28658 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atxn10P28658 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atxn10P28658 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atxn10P28658 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atxn10P28658 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atxn10P28658 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Atxn10P28658 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atxn10P28658 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atxn10P28658 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atxn10P28658 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atxn10P28658 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atxn10P28658 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atxn10P28658 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atxn10P28658 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atxn10P28658 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atxn10P28658 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atxn10P28658 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Atxn10P28658 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atxn10P28658 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atxn10P28658 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atxn10P28658 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atxn10P28658 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atxn10P28658 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atxn10P28658 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atxn10P28658 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atxn10P28658 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atxn10P28658 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atxn10P28658 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atxn10P28658 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atxn10P28658 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atxn10P28658 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atxn10P28658 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atxn10P28658 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atxn10P28658 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Atxn10P28658 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atxn10P28658 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atxn10P28658 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atxn10P28658 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atxn10P28658 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atxn10P28658 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atxn10P28658 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Atxn10P28658 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atxn10P28658 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atxn10P28658 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atxn10P28658 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atxn10P28658 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atxn10P28658 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atxn10P28658 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Atxn10P28658 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atxn10P28658 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atxn10P28658 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atxn10P28658 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atxn10P28658 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atxn10P28658 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Atxn10P28658 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atxn10P28658 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atxn10P28658 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atxn10P28658 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atxn10P28658 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atxn10P28658 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atxn10P28658 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atxn10P28658 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Atxn10P28658 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Atxn10P28658 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atxn10P28658 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn10P28658 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn10P28658 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn10P28658 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn10P28658 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn10P28658 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn10P28658 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn10P28658 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn10P28658 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn10P28658 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn10P28658 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn10P28658 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atxn10P28658 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atxn10P28658 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atxn10P28658 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atxn10P28658 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atxn10P28658 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atxn10P28658 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Atxn10P28658 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atxn10P28658 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atxn10P28658 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atxn10P28658 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Atxn10P28658 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.5 ms