Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BgnP28653 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BgnP28653 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BgnP28653 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BgnP28653 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BgnP28653 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BgnP28653 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BgnP28653 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BgnP28653 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BgnP28653 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BgnP28653 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BgnP28653 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BgnP28653 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BgnP28653 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BgnP28653 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BgnP28653 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BgnP28653 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BgnP28653 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BgnP28653 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BgnP28653 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BgnP28653 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BgnP28653 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BgnP28653 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BgnP28653 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BgnP28653 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BgnP28653 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BgnP28653 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BgnP28653 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BgnP28653 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BgnP28653 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BgnP28653 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BgnP28653 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BgnP28653 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BgnP28653 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BgnP28653 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BgnP28653 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BgnP28653 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BgnP28653 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BgnP28653 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BgnP28653 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BgnP28653 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BgnP28653 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BgnP28653 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BgnP28653 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BgnP28653 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BgnP28653 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BgnP28653 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BgnP28653 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BgnP28653 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BgnP28653 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BgnP28653 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BgnP28653 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BgnP28653 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BgnP28653 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BgnP28653 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BgnP28653 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BgnP28653 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BgnP28653 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BgnP28653 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BgnP28653 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BgnP28653 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BgnP28653 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BgnP28653 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BgnP28653 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BgnP28653 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BgnP28653 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BgnP28653 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BgnP28653 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BgnP28653 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BgnP28653 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BgnP28653 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BgnP28653 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BgnP28653 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BgnP28653 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BgnP28653 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BgnP28653 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BgnP28653 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BgnP28653 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BgnP28653 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BgnP28653 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BgnP28653 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BgnP28653 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BgnP28653 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BgnP28653 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BgnP28653 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BgnP28653 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BgnP28653 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BgnP28653 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BgnP28653 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BgnP28653 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BgnP28653 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BgnP28653 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BgnP28653 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BgnP28653 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BgnP28653 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BgnP28653 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BgnP28653 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BgnP28653 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BgnP28653 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BgnP28653 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms