Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apex1P28352 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apex1P28352 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apex1P28352 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apex1P28352 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apex1P28352 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apex1P28352 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apex1P28352 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apex1P28352 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apex1P28352 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apex1P28352 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apex1P28352 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Apex1P28352 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apex1P28352 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apex1P28352 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apex1P28352 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apex1P28352 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apex1P28352 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Apex1P28352 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apex1P28352 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apex1P28352 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apex1P28352 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apex1P28352 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apex1P28352 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apex1P28352 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apex1P28352 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apex1P28352 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apex1P28352 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apex1P28352 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apex1P28352 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apex1P28352 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apex1P28352 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apex1P28352 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apex1P28352 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apex1P28352 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apex1P28352 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apex1P28352 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apex1P28352 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apex1P28352 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apex1P28352 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apex1P28352 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Apex1P28352 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apex1P28352 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apex1P28352 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apex1P28352 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apex1P28352 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apex1P28352 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apex1P28352 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apex1P28352 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apex1P28352 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apex1P28352 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apex1P28352 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apex1P28352 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apex1P28352 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apex1P28352 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apex1P28352 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apex1P28352 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apex1P28352 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apex1P28352 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apex1P28352 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apex1P28352 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apex1P28352 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apex1P28352 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Apex1P28352 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apex1P28352 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apex1P28352 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apex1P28352 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apex1P28352 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apex1P28352 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apex1P28352 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Apex1P28352 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apex1P28352 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apex1P28352 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apex1P28352 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apex1P28352 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apex1P28352 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apex1P28352 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apex1P28352 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apex1P28352 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apex1P28352 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apex1P28352 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apex1P28352 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apex1P28352 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apex1P28352 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apex1P28352 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apex1P28352 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apex1P28352 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apex1P28352 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apex1P28352 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apex1P28352 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apex1P28352 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apex1P28352 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apex1P28352 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms