Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctnna1P26231 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctnna1P26231 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctnna1P26231 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctnna1P26231 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctnna1P26231 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctnna1P26231 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctnna1P26231 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctnna1P26231 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctnna1P26231 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctnna1P26231 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctnna1P26231 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctnna1P26231 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctnna1P26231 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctnna1P26231 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctnna1P26231 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctnna1P26231 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctnna1P26231 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctnna1P26231 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctnna1P26231 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctnna1P26231 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctnna1P26231 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctnna1P26231 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctnna1P26231 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctnna1P26231 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctnna1P26231 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctnna1P26231 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctnna1P26231 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctnna1P26231 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctnna1P26231 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctnna1P26231 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ctnna1P26231 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ctnna1P26231 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ctnna1P26231 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ctnna1P26231 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctnna1P26231 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctnna1P26231 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctnna1P26231 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctnna1P26231 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctnna1P26231 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctnna1P26231 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctnna1P26231 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctnna1P26231 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctnna1P26231 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctnna1P26231 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctnna1P26231 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctnna1P26231 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctnna1P26231 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctnna1P26231 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctnna1P26231 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctnna1P26231 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctnna1P26231 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctnna1P26231 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctnna1P26231 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctnna1P26231 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctnna1P26231 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctnna1P26231 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctnna1P26231 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctnna1P26231 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctnna1P26231 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctnna1P26231 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctnna1P26231 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctnna1P26231 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctnna1P26231 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctnna1P26231 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctnna1P26231 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctnna1P26231 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctnna1P26231 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctnna1P26231 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctnna1P26231 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctnna1P26231 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctnna1P26231 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctnna1P26231 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122 ms