Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NdnP25233 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NdnP25233 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NdnP25233 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NdnP25233 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NdnP25233 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NdnP25233 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NdnP25233 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NdnP25233 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NdnP25233 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NdnP25233 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NdnP25233 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NdnP25233 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NdnP25233 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NdnP25233 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NdnP25233 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NdnP25233 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NdnP25233 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NdnP25233 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NdnP25233 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NdnP25233 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NdnP25233 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NdnP25233 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NdnP25233 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NdnP25233 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NdnP25233 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NdnP25233 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NdnP25233 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NdnP25233 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NdnP25233 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NdnP25233 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NdnP25233 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NdnP25233 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NdnP25233 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NdnP25233 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NdnP25233 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NdnP25233 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NdnP25233 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NdnP25233 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NdnP25233 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NdnP25233 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NdnP25233 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NdnP25233 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NdnP25233 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NdnP25233 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NdnP25233 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NdnP25233 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NdnP25233 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NdnP25233 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NdnP25233 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NdnP25233 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NdnP25233 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NdnP25233 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NdnP25233 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NdnP25233 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NdnP25233 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NdnP25233 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NdnP25233 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NdnP25233 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NdnP25233 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NdnP25233 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NdnP25233 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NdnP25233 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NdnP25233 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NdnP25233 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NdnP25233 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NdnP25233 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NdnP25233 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NdnP25233 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NdnP25233 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NdnP25233 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NdnP25233 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NdnP25233 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NdnP25233 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NdnP25233 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NdnP25233 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NdnP25233 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NdnP25233 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NdnP25233 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NdnP25233 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NdnP25233 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NdnP25233 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NdnP25233 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NdnP25233 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NdnP25233 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NdnP25233 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NdnP25233 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NdnP25233 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NdnP25233 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NdnP25233 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NdnP25233 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NdnP25233 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NdnP25233 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NdnP25233 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NdnP25233 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NdnP25233 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NdnP25233 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NdnP25233 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NdnP25233 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NdnP25233 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms