Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Htr3aP23979 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Htr3aP23979 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Htr3aP23979 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Htr3aP23979 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Htr3aP23979 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Htr3aP23979 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Htr3aP23979 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Htr3aP23979 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Htr3aP23979 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Htr3aP23979 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Htr3aP23979 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Htr3aP23979 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Htr3aP23979 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Htr3aP23979 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Htr3aP23979 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Htr3aP23979 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Htr3aP23979 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Htr3aP23979 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Htr3aP23979 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htr3aP23979 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htr3aP23979 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htr3aP23979 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htr3aP23979 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htr3aP23979 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htr3aP23979 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htr3aP23979 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htr3aP23979 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htr3aP23979 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htr3aP23979 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr3aP23979 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr3aP23979 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr3aP23979 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htr3aP23979 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htr3aP23979 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htr3aP23979 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htr3aP23979 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htr3aP23979 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Htr3aP23979 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Htr3aP23979 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Htr3aP23979 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr3aP23979 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr3aP23979 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr3aP23979 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr3aP23979 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Htr3aP23979 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Htr3aP23979 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htr3aP23979 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr3aP23979 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr3aP23979 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr3aP23979 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr3aP23979 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr3aP23979 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htr3aP23979 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htr3aP23979 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htr3aP23979 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htr3aP23979 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Htr3aP23979 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Htr3aP23979 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htr3aP23979 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htr3aP23979 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htr3aP23979 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htr3aP23979 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htr3aP23979 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htr3aP23979 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htr3aP23979 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htr3aP23979 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htr3aP23979 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htr3aP23979 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htr3aP23979 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htr3aP23979 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htr3aP23979 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htr3aP23979 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htr3aP23979 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htr3aP23979 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms