Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxd12P23812 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxd12P23812 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxd12P23812 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxd12P23812 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxd12P23812 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxd12P23812 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxd12P23812 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxd12P23812 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxd12P23812 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hoxd12P23812 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxd12P23812 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxd12P23812 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxd12P23812 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxd12P23812 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxd12P23812 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxd12P23812 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxd12P23812 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxd12P23812 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxd12P23812 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxd12P23812 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxd12P23812 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxd12P23812 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxd12P23812 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxd12P23812 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxd12P23812 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxd12P23812 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd12P23812 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxd12P23812 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxd12P23812 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxd12P23812 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxd12P23812 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxd12P23812 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxd12P23812 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxd12P23812 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxd12P23812 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxd12P23812 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxd12P23812 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxd12P23812 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxd12P23812 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxd12P23812 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxd12P23812 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxd12P23812 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxd12P23812 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxd12P23812 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxd12P23812 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxd12P23812 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxd12P23812 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hoxd12P23812 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxd12P23812 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxd12P23812 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxd12P23812 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxd12P23812 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxd12P23812 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxd12P23812 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxd12P23812 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxd12P23812 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxd12P23812 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxd12P23812 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxd12P23812 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxd12P23812 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxd12P23812 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxd12P23812 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd12P23812 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd12P23812 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd12P23812 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxd12P23812 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxd12P23812 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxd12P23812 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxd12P23812 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd12P23812 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxd12P23812 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxd12P23812 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxd12P23812 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxd12P23812 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd12P23812 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd12P23812 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxd12P23812 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxd12P23812 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxd12P23812 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hoxd12P23812 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxd12P23812 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxd12P23812 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxd12P23812 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd12P23812 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd12P23812 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd12P23812 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd12P23812 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxd12P23812 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxd12P23812 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxd12P23812 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxd12P23812 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxd12P23812 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxd12P23812 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxd12P23812 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxd12P23812 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxd12P23812 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxd12P23812 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxd12P23812 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxd12P23812 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms