Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrkchP23298 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrkchP23298 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrkchP23298 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkchP23298 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkchP23298 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkchP23298 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkchP23298 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkchP23298 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkchP23298 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkchP23298 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrkchP23298 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PrkchP23298 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrkchP23298 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrkchP23298 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrkchP23298 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkchP23298 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkchP23298 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkchP23298 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkchP23298 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkchP23298 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkchP23298 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkchP23298 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrkchP23298 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrkchP23298 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrkchP23298 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrkchP23298 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrkchP23298 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkchP23298 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkchP23298 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkchP23298 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrkchP23298 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrkchP23298 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrkchP23298 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkchP23298 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkchP23298 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkchP23298 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkchP23298 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkchP23298 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrkchP23298 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrkchP23298 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrkchP23298 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PrkchP23298 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrkchP23298 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrkchP23298 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrkchP23298 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrkchP23298 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrkchP23298 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrkchP23298 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrkchP23298 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PrkchP23298 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrkchP23298 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PrkchP23298 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrkchP23298 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrkchP23298 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrkchP23298 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrkchP23298 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrkchP23298 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrkchP23298 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrkchP23298 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrkchP23298 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrkchP23298 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrkchP23298 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrkchP23298 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrkchP23298 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrkchP23298 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PrkchP23298 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkchP23298 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkchP23298 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkchP23298 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkchP23298 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PrkchP23298 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkchP23298 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkchP23298 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkchP23298 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkchP23298 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkchP23298 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrkchP23298 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PrkchP23298 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrkchP23298 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrkchP23298 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PrkchP23298 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrkchP23298 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PrkchP23298 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkchP23298 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkchP23298 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkchP23298 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkchP23298 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkchP23298 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkchP23298 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkchP23298 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrkchP23298 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrkchP23298 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrkchP23298 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrkchP23298 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrkchP23298 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrkchP23298 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrkchP23298 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrkchP23298 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PrkchP23298 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms