Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PparaP23204 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PparaP23204 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PparaP23204 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PparaP23204 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PparaP23204 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PparaP23204 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PparaP23204 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PparaP23204 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PparaP23204 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PparaP23204 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PparaP23204 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PparaP23204 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PparaP23204 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PparaP23204 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PparaP23204 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PparaP23204 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PparaP23204 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PparaP23204 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PparaP23204 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PparaP23204 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PparaP23204 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PparaP23204 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PparaP23204 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PparaP23204 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PparaP23204 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PparaP23204 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PparaP23204 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PparaP23204 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PparaP23204 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PparaP23204 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PparaP23204 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PparaP23204 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PparaP23204 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PparaP23204 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PparaP23204 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PparaP23204 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PparaP23204 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PparaP23204 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PparaP23204 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PparaP23204 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PparaP23204 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PparaP23204 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PparaP23204 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PparaP23204 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PparaP23204 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PparaP23204 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PparaP23204 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PparaP23204 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PparaP23204 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PparaP23204 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PparaP23204 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PparaP23204 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PparaP23204 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PparaP23204 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PparaP23204 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PparaP23204 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PparaP23204 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PparaP23204 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PparaP23204 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PparaP23204 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PparaP23204 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PparaP23204 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PparaP23204 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PparaP23204 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PparaP23204 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PparaP23204 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PparaP23204 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PparaP23204 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PparaP23204 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PparaP23204 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PparaP23204 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PparaP23204 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PparaP23204 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PparaP23204 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PparaP23204 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PparaP23204 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PparaP23204 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PparaP23204 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PparaP23204 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PparaP23204 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PparaP23204 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PparaP23204 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PparaP23204 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PparaP23204 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PparaP23204 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PparaP23204 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PparaP23204 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PparaP23204 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PparaP23204 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PparaP23204 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PparaP23204 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PparaP23204 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PparaP23204 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PparaP23204 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PparaP23204 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PparaP23204 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PparaP23204 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PparaP23204 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PparaP23204 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms