Protein–RNA interactions for Protein: P22907

Hmbs, Porphobilinogen deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmbsP22907 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HmbsP22907 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HmbsP22907 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HmbsP22907 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HmbsP22907 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HmbsP22907 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HmbsP22907 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HmbsP22907 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HmbsP22907 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HmbsP22907 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HmbsP22907 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HmbsP22907 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HmbsP22907 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HmbsP22907 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HmbsP22907 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HmbsP22907 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HmbsP22907 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HmbsP22907 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HmbsP22907 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HmbsP22907 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HmbsP22907 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HmbsP22907 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HmbsP22907 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HmbsP22907 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HmbsP22907 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HmbsP22907 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HmbsP22907 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HmbsP22907 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HmbsP22907 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HmbsP22907 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HmbsP22907 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HmbsP22907 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HmbsP22907 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HmbsP22907 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HmbsP22907 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HmbsP22907 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HmbsP22907 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HmbsP22907 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HmbsP22907 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HmbsP22907 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HmbsP22907 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HmbsP22907 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HmbsP22907 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HmbsP22907 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HmbsP22907 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HmbsP22907 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HmbsP22907 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HmbsP22907 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HmbsP22907 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HmbsP22907 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HmbsP22907 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HmbsP22907 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HmbsP22907 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HmbsP22907 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HmbsP22907 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HmbsP22907 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HmbsP22907 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HmbsP22907 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HmbsP22907 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HmbsP22907 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HmbsP22907 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HmbsP22907 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HmbsP22907 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HmbsP22907 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HmbsP22907 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HmbsP22907 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HmbsP22907 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HmbsP22907 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HmbsP22907 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HmbsP22907 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HmbsP22907 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HmbsP22907 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HmbsP22907 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HmbsP22907 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HmbsP22907 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HmbsP22907 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HmbsP22907 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HmbsP22907 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HmbsP22907 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HmbsP22907 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HmbsP22907 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HmbsP22907 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HmbsP22907 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HmbsP22907 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HmbsP22907 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HmbsP22907 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HmbsP22907 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HmbsP22907 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HmbsP22907 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HmbsP22907 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HmbsP22907 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HmbsP22907 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HmbsP22907 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HmbsP22907 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HmbsP22907 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HmbsP22907 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HmbsP22907 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HmbsP22907 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HmbsP22907 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HmbsP22907 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms