Protein–RNA interactions for Protein: P22005

Penk, Proenkephalin-A, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PenkP22005 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PenkP22005 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PenkP22005 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PenkP22005 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PenkP22005 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PenkP22005 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PenkP22005 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PenkP22005 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PenkP22005 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PenkP22005 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PenkP22005 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PenkP22005 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PenkP22005 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PenkP22005 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PenkP22005 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PenkP22005 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PenkP22005 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PenkP22005 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PenkP22005 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PenkP22005 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PenkP22005 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PenkP22005 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PenkP22005 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PenkP22005 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PenkP22005 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PenkP22005 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PenkP22005 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PenkP22005 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PenkP22005 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PenkP22005 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PenkP22005 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PenkP22005 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PenkP22005 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PenkP22005 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PenkP22005 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PenkP22005 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PenkP22005 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PenkP22005 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PenkP22005 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PenkP22005 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PenkP22005 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PenkP22005 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PenkP22005 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PenkP22005 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PenkP22005 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PenkP22005 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PenkP22005 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PenkP22005 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PenkP22005 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PenkP22005 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PenkP22005 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PenkP22005 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PenkP22005 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PenkP22005 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PenkP22005 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PenkP22005 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PenkP22005 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PenkP22005 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PenkP22005 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PenkP22005 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PenkP22005 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PenkP22005 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PenkP22005 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PenkP22005 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PenkP22005 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PenkP22005 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PenkP22005 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PenkP22005 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PenkP22005 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PenkP22005 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PenkP22005 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PenkP22005 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PenkP22005 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PenkP22005 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PenkP22005 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PenkP22005 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PenkP22005 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PenkP22005 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PenkP22005 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PenkP22005 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PenkP22005 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PenkP22005 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PenkP22005 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PenkP22005 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PenkP22005 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PenkP22005 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PenkP22005 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PenkP22005 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PenkP22005 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PenkP22005 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PenkP22005 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PenkP22005 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PenkP22005 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PenkP22005 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PenkP22005 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PenkP22005 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PenkP22005 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PenkP22005 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PenkP22005 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PenkP22005 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms