Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmnb2P21619 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmnb2P21619 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmnb2P21619 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmnb2P21619 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmnb2P21619 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmnb2P21619 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmnb2P21619 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmnb2P21619 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmnb2P21619 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmnb2P21619 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmnb2P21619 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmnb2P21619 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmnb2P21619 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmnb2P21619 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmnb2P21619 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmnb2P21619 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmnb2P21619 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmnb2P21619 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmnb2P21619 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmnb2P21619 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmnb2P21619 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmnb2P21619 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmnb2P21619 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmnb2P21619 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmnb2P21619 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmnb2P21619 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmnb2P21619 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmnb2P21619 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmnb2P21619 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmnb2P21619 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmnb2P21619 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmnb2P21619 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmnb2P21619 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmnb2P21619 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmnb2P21619 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmnb2P21619 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmnb2P21619 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmnb2P21619 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmnb2P21619 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmnb2P21619 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmnb2P21619 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmnb2P21619 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmnb2P21619 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmnb2P21619 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmnb2P21619 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmnb2P21619 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmnb2P21619 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lmnb2P21619 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lmnb2P21619 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lmnb2P21619 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lmnb2P21619 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmnb2P21619 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmnb2P21619 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmnb2P21619 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmnb2P21619 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmnb2P21619 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmnb2P21619 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmnb2P21619 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmnb2P21619 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmnb2P21619 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmnb2P21619 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmnb2P21619 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmnb2P21619 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmnb2P21619 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmnb2P21619 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmnb2P21619 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmnb2P21619 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmnb2P21619 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmnb2P21619 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmnb2P21619 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms