Protein–RNA interactions for Protein: P19973

Lsp1, Lymphocyte-specific protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsp1P19973 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lsp1P19973 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lsp1P19973 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lsp1P19973 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lsp1P19973 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lsp1P19973 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lsp1P19973 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lsp1P19973 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lsp1P19973 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lsp1P19973 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lsp1P19973 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lsp1P19973 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Lsp1P19973 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lsp1P19973 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lsp1P19973 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lsp1P19973 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lsp1P19973 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Lsp1P19973 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lsp1P19973 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lsp1P19973 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lsp1P19973 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lsp1P19973 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lsp1P19973 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lsp1P19973 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lsp1P19973 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lsp1P19973 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lsp1P19973 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lsp1P19973 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lsp1P19973 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lsp1P19973 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lsp1P19973 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lsp1P19973 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lsp1P19973 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lsp1P19973 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lsp1P19973 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lsp1P19973 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lsp1P19973 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lsp1P19973 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lsp1P19973 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lsp1P19973 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lsp1P19973 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lsp1P19973 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lsp1P19973 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lsp1P19973 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lsp1P19973 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lsp1P19973 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lsp1P19973 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lsp1P19973 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lsp1P19973 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lsp1P19973 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lsp1P19973 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lsp1P19973 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lsp1P19973 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Lsp1P19973 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lsp1P19973 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lsp1P19973 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lsp1P19973 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lsp1P19973 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Lsp1P19973 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lsp1P19973 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lsp1P19973 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lsp1P19973 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lsp1P19973 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lsp1P19973 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lsp1P19973 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lsp1P19973 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lsp1P19973 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lsp1P19973 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lsp1P19973 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Lsp1P19973 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Lsp1P19973 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lsp1P19973 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lsp1P19973 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lsp1P19973 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lsp1P19973 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lsp1P19973 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lsp1P19973 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lsp1P19973 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lsp1P19973 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lsp1P19973 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lsp1P19973 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lsp1P19973 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lsp1P19973 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lsp1P19973 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lsp1P19973 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lsp1P19973 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lsp1P19973 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lsp1P19973 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lsp1P19973 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Lsp1P19973 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lsp1P19973 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lsp1P19973 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lsp1P19973 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lsp1P19973 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lsp1P19973 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lsp1P19973 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lsp1P19973 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lsp1P19973 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lsp1P19973 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lsp1P19973 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms