Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl13aP19253 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl13aP19253 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl13aP19253 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl13aP19253 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl13aP19253 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rpl13aP19253 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl13aP19253 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl13aP19253 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl13aP19253 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl13aP19253 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl13aP19253 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl13aP19253 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl13aP19253 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl13aP19253 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl13aP19253 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl13aP19253 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl13aP19253 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl13aP19253 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl13aP19253 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl13aP19253 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl13aP19253 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl13aP19253 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl13aP19253 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl13aP19253 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl13aP19253 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl13aP19253 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rpl13aP19253 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl13aP19253 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms