Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtsdP18242 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtsdP18242 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtsdP18242 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtsdP18242 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CtsdP18242 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CtsdP18242 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtsdP18242 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtsdP18242 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtsdP18242 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtsdP18242 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CtsdP18242 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtsdP18242 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsdP18242 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsdP18242 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsdP18242 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsdP18242 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsdP18242 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtsdP18242 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtsdP18242 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsdP18242 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsdP18242 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsdP18242 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CtsdP18242 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CtsdP18242 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CtsdP18242 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsdP18242 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsdP18242 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsdP18242 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtsdP18242 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtsdP18242 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtsdP18242 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CtsdP18242 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CtsdP18242 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsdP18242 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtsdP18242 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtsdP18242 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CtsdP18242 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CtsdP18242 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtsdP18242 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtsdP18242 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsdP18242 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsdP18242 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtsdP18242 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CtsdP18242 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CtsdP18242 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsdP18242 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsdP18242 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtsdP18242 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtsdP18242 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtsdP18242 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtsdP18242 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtsdP18242 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtsdP18242 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtsdP18242 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtsdP18242 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtsdP18242 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsdP18242 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsdP18242 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsdP18242 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsdP18242 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsdP18242 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtsdP18242 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtsdP18242 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsdP18242 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsdP18242 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsdP18242 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtsdP18242 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsdP18242 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsdP18242 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsdP18242 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsdP18242 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsdP18242 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtsdP18242 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsdP18242 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsdP18242 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtsdP18242 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CtsdP18242 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CtsdP18242 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CtsdP18242 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CtsdP18242 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtsdP18242 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtsdP18242 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtsdP18242 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtsdP18242 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtsdP18242 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsdP18242 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsdP18242 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsdP18242 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsdP18242 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsdP18242 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsdP18242 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsdP18242 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsdP18242 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsdP18242 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtsdP18242 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsdP18242 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsdP18242 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsdP18242 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsdP18242 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms