Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rag1P15919 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rag1P15919 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rag1P15919 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rag1P15919 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rag1P15919 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rag1P15919 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rag1P15919 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rag1P15919 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rag1P15919 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rag1P15919 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rag1P15919 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rag1P15919 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rag1P15919 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rag1P15919 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rag1P15919 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rag1P15919 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rag1P15919 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rag1P15919 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rag1P15919 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rag1P15919 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rag1P15919 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rag1P15919 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rag1P15919 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rag1P15919 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rag1P15919 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rag1P15919 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rag1P15919 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rag1P15919 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rag1P15919 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rag1P15919 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rag1P15919 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rag1P15919 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rag1P15919 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rag1P15919 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rag1P15919 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rag1P15919 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rag1P15919 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rag1P15919 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rag1P15919 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rag1P15919 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rag1P15919 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rag1P15919 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rag1P15919 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rag1P15919 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rag1P15919 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rag1P15919 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rag1P15919 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rag1P15919 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rag1P15919 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rag1P15919 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rag1P15919 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rag1P15919 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rag1P15919 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rag1P15919 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rag1P15919 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rag1P15919 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rag1P15919 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rag1P15919 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rag1P15919 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rag1P15919 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rag1P15919 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rag1P15919 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rag1P15919 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rag1P15919 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rag1P15919 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rag1P15919 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rag1P15919 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rag1P15919 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rag1P15919 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rag1P15919 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rag1P15919 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Rag1P15919 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rag1P15919 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rag1P15919 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rag1P15919 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rag1P15919 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rag1P15919 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rag1P15919 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rag1P15919 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rag1P15919 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rag1P15919 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rag1P15919 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rag1P15919 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rag1P15919 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rag1P15919 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rag1P15919 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rag1P15919 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rag1P15919 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rag1P15919 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rag1P15919 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rag1P15919 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rag1P15919 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rag1P15919 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rag1P15919 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rag1P15919 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rag1P15919 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rag1P15919 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rag1P15919 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rag1P15919 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms