Protein–RNA interactions for Protein: P15702

Spn, Leukosialin, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpnP15702 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SpnP15702 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SpnP15702 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SpnP15702 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SpnP15702 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SpnP15702 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SpnP15702 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SpnP15702 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SpnP15702 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SpnP15702 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SpnP15702 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SpnP15702 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SpnP15702 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SpnP15702 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SpnP15702 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SpnP15702 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SpnP15702 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SpnP15702 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SpnP15702 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SpnP15702 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SpnP15702 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SpnP15702 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SpnP15702 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SpnP15702 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SpnP15702 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SpnP15702 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SpnP15702 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SpnP15702 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SpnP15702 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SpnP15702 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SpnP15702 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SpnP15702 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SpnP15702 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SpnP15702 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SpnP15702 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SpnP15702 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SpnP15702 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SpnP15702 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SpnP15702 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SpnP15702 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SpnP15702 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SpnP15702 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SpnP15702 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SpnP15702 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SpnP15702 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SpnP15702 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SpnP15702 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SpnP15702 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SpnP15702 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SpnP15702 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SpnP15702 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SpnP15702 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SpnP15702 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SpnP15702 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SpnP15702 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpnP15702 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpnP15702 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpnP15702 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpnP15702 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpnP15702 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpnP15702 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpnP15702 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpnP15702 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpnP15702 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpnP15702 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SpnP15702 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SpnP15702 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SpnP15702 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SpnP15702 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SpnP15702 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SpnP15702 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SpnP15702 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpnP15702 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpnP15702 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpnP15702 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpnP15702 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SpnP15702 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SpnP15702 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SpnP15702 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SpnP15702 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SpnP15702 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SpnP15702 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SpnP15702 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SpnP15702 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SpnP15702 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SpnP15702 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SpnP15702 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SpnP15702 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SpnP15702 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SpnP15702 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SpnP15702 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SpnP15702 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SpnP15702 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SpnP15702 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SpnP15702 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SpnP15702 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SpnP15702 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SpnP15702 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SpnP15702 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SpnP15702 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms