Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tcp1P11983 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tcp1P11983 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tcp1P11983 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tcp1P11983 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tcp1P11983 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tcp1P11983 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tcp1P11983 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tcp1P11983 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tcp1P11983 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tcp1P11983 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tcp1P11983 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tcp1P11983 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tcp1P11983 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tcp1P11983 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tcp1P11983 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tcp1P11983 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tcp1P11983 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tcp1P11983 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tcp1P11983 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tcp1P11983 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tcp1P11983 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tcp1P11983 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tcp1P11983 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tcp1P11983 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tcp1P11983 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tcp1P11983 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tcp1P11983 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcp1P11983 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcp1P11983 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcp1P11983 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcp1P11983 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcp1P11983 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcp1P11983 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcp1P11983 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tcp1P11983 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tcp1P11983 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tcp1P11983 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcp1P11983 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcp1P11983 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tcp1P11983 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tcp1P11983 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tcp1P11983 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tcp1P11983 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tcp1P11983 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcp1P11983 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcp1P11983 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcp1P11983 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcp1P11983 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcp1P11983 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcp1P11983 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcp1P11983 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcp1P11983 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.56
Tcp1P11983 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcp1P11983 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcp1P11983 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcp1P11983 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcp1P11983 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcp1P11983 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcp1P11983 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcp1P11983 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcp1P11983 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcp1P11983 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tcp1P11983 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tcp1P11983 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcp1P11983 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcp1P11983 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcp1P11983 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcp1P11983 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcp1P11983 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcp1P11983 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcp1P11983 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcp1P11983 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcp1P11983 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcp1P11983 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcp1P11983 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcp1P11983 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcp1P11983 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tcp1P11983 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcp1P11983 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcp1P11983 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcp1P11983 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcp1P11983 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tcp1P11983 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tcp1P11983 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tcp1P11983 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcp1P11983 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcp1P11983 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcp1P11983 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tcp1P11983 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tcp1P11983 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tcp1P11983 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcp1P11983 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcp1P11983 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcp1P11983 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcp1P11983 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcp1P11983 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcp1P11983 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcp1P11983 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcp1P11983 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms