Protein–RNA interactions for Protein: P11440

Cdk1, Cyclin-dependent kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk1P11440 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk1P11440 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk1P11440 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk1P11440 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk1P11440 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk1P11440 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk1P11440 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk1P11440 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk1P11440 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk1P11440 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk1P11440 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk1P11440 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk1P11440 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk1P11440 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk1P11440 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk1P11440 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk1P11440 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk1P11440 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdk1P11440 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdk1P11440 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk1P11440 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk1P11440 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk1P11440 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk1P11440 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk1P11440 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk1P11440 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk1P11440 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdk1P11440 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdk1P11440 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk1P11440 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk1P11440 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk1P11440 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk1P11440 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk1P11440 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk1P11440 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk1P11440 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk1P11440 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk1P11440 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk1P11440 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdk1P11440 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdk1P11440 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdk1P11440 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdk1P11440 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdk1P11440 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk1P11440 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk1P11440 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk1P11440 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdk1P11440 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdk1P11440 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdk1P11440 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdk1P11440 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdk1P11440 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdk1P11440 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdk1P11440 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk1P11440 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk1P11440 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk1P11440 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk1P11440 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk1P11440 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk1P11440 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdk1P11440 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdk1P11440 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdk1P11440 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdk1P11440 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdk1P11440 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdk1P11440 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdk1P11440 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdk1P11440 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdk1P11440 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdk1P11440 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdk1P11440 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms