Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sub1P11031 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sub1P11031 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sub1P11031 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sub1P11031 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sub1P11031 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sub1P11031 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sub1P11031 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sub1P11031 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sub1P11031 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sub1P11031 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sub1P11031 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sub1P11031 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sub1P11031 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sub1P11031 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sub1P11031 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sub1P11031 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sub1P11031 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sub1P11031 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sub1P11031 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sub1P11031 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sub1P11031 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sub1P11031 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sub1P11031 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sub1P11031 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sub1P11031 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sub1P11031 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sub1P11031 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sub1P11031 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sub1P11031 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sub1P11031 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sub1P11031 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sub1P11031 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sub1P11031 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sub1P11031 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sub1P11031 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sub1P11031 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sub1P11031 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sub1P11031 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sub1P11031 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms