Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsbP10605 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsbP10605 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsbP10605 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsbP10605 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsbP10605 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsbP10605 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsbP10605 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsbP10605 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsbP10605 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsbP10605 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsbP10605 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsbP10605 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsbP10605 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsbP10605 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsbP10605 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsbP10605 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsbP10605 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsbP10605 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsbP10605 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsbP10605 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtsbP10605 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsbP10605 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsbP10605 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsbP10605 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsbP10605 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtsbP10605 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsbP10605 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsbP10605 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsbP10605 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsbP10605 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsbP10605 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtsbP10605 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsbP10605 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CtsbP10605 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtsbP10605 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtsbP10605 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CtsbP10605 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CtsbP10605 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtsbP10605 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtsbP10605 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtsbP10605 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtsbP10605 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CtsbP10605 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtsbP10605 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtsbP10605 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtsbP10605 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CtsbP10605 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtsbP10605 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtsbP10605 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtsbP10605 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtsbP10605 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CtsbP10605 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsbP10605 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsbP10605 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CtsbP10605 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CtsbP10605 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CtsbP10605 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtsbP10605 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtsbP10605 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtsbP10605 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtsbP10605 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtsbP10605 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CtsbP10605 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CtsbP10605 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtsbP10605 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CtsbP10605 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtsbP10605 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtsbP10605 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtsbP10605 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtsbP10605 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsbP10605 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsbP10605 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsbP10605 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtsbP10605 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtsbP10605 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtsbP10605 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtsbP10605 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtsbP10605 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtsbP10605 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.79
CtsbP10605 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtsbP10605 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtsbP10605 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtsbP10605 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtsbP10605 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtsbP10605 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtsbP10605 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtsbP10605 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtsbP10605 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtsbP10605 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtsbP10605 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtsbP10605 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtsbP10605 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtsbP10605 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtsbP10605 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtsbP10605 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtsbP10605 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtsbP10605 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtsbP10605 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtsbP10605 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms