Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myod1P10085 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myod1P10085 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myod1P10085 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myod1P10085 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myod1P10085 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myod1P10085 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myod1P10085 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myod1P10085 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myod1P10085 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myod1P10085 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myod1P10085 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myod1P10085 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myod1P10085 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myod1P10085 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myod1P10085 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myod1P10085 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myod1P10085 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myod1P10085 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myod1P10085 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myod1P10085 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myod1P10085 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myod1P10085 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myod1P10085 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myod1P10085 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myod1P10085 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Myod1P10085 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myod1P10085 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Myod1P10085 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myod1P10085 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Myod1P10085 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Myod1P10085 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Myod1P10085 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Myod1P10085 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Myod1P10085 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Myod1P10085 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Myod1P10085 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Myod1P10085 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Myod1P10085 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Myod1P10085 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myod1P10085 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Myod1P10085 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myod1P10085 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Myod1P10085 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Myod1P10085 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myod1P10085 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myod1P10085 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myod1P10085 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myod1P10085 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myod1P10085 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Myod1P10085 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myod1P10085 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myod1P10085 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Myod1P10085 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myod1P10085 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myod1P10085 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Myod1P10085 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myod1P10085 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myod1P10085 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Myod1P10085 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Myod1P10085 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Myod1P10085 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myod1P10085 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Myod1P10085 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Myod1P10085 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Myod1P10085 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myod1P10085 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myod1P10085 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myod1P10085 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myod1P10085 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myod1P10085 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Myod1P10085 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myod1P10085 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Myod1P10085 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myod1P10085 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Myod1P10085 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myod1P10085 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myod1P10085 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myod1P10085 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myod1P10085 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Myod1P10085 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms