Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnmt3cP0DOY1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnmt3cP0DOY1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnmt3cP0DOY1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnmt3cP0DOY1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnmt3cP0DOY1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnmt3cP0DOY1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnmt3cP0DOY1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Dnmt3cP0DOY1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnmt3cP0DOY1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnmt3cP0DOY1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnmt3cP0DOY1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnmt3cP0DOY1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt3cP0DOY1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt3cP0DOY1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt3cP0DOY1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt3cP0DOY1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt3cP0DOY1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt3cP0DOY1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnmt3cP0DOY1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnmt3cP0DOY1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnmt3cP0DOY1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Dnmt3cP0DOY1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dnmt3cP0DOY1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Dnmt3cP0DOY1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dnmt3cP0DOY1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dnmt3cP0DOY1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dnmt3cP0DOY1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnmt3cP0DOY1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnmt3cP0DOY1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnmt3cP0DOY1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnmt3cP0DOY1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnmt3cP0DOY1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnmt3cP0DOY1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnmt3cP0DOY1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnmt3cP0DOY1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnmt3cP0DOY1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnmt3cP0DOY1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnmt3cP0DOY1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnmt3cP0DOY1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt3cP0DOY1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt3cP0DOY1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnmt3cP0DOY1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnmt3cP0DOY1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnmt3cP0DOY1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnmt3cP0DOY1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnmt3cP0DOY1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnmt3cP0DOY1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnmt3cP0DOY1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnmt3cP0DOY1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnmt3cP0DOY1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnmt3cP0DOY1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnmt3cP0DOY1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnmt3cP0DOY1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnmt3cP0DOY1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnmt3cP0DOY1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnmt3cP0DOY1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnmt3cP0DOY1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnmt3cP0DOY1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnmt3cP0DOY1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnmt3cP0DOY1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnmt3cP0DOY1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnmt3cP0DOY1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnmt3cP0DOY1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnmt3cP0DOY1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnmt3cP0DOY1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Dnmt3cP0DOY1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dnmt3cP0DOY1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dnmt3cP0DOY1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnmt3cP0DOY1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnmt3cP0DOY1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms